Для этого вам следует использовать систему виртуализации. Например
VirtualBox. Если нужна 3D графика, то использовать полноценный гипервизор с поддержкой проброса PCI-E устройств в виртуальные машины.
И написать скрипты для любого автоматизатора для дублирования пользовательского ввода или же найти что-то готовое. В винде пользовательский ввод работает только для текущего активного окна. Так устроена ОС и ничего с этим не сделать. Да, есть API для отправки сообщений любым окнам, но в играх оно не используется. Плюс ещё в играх часто есть детекторы виртуализации, эмуляции ввода и другие античиты. Ещё один вариант эмуляции пользовательского ввода — это использовать свой драйвер ядра. Но для этого его надо подписать, что денег стоит либо отключить половину системы безопасности ОС. На форуме autohotkey есть топик с этим драйвером, но как оно там сейчас дело обстоит — я не знаю, т.к. это теме лет 10 или 15.