Монга использует mmap и соотв. не позволяет работать с базами >2Gb на 32-битных системах.
Для нормальной работы требуется 64-битная платформа, ос и сама монга.
Если у вас есть только x32 и не-крошечная база, то монга просто не для вас.
Предположу, что без кода на клиенте, это можно сделать либо через Map/Reduce (а он вроде блокирующий), либо Aggregation Framework, который здесь уже упоминался, но будет только в 2.2.
Буду приятно удивлен, если можно проще.