flyte

var ind = false;
var cycle

item.onclick = function(){
    if (!ind) {
        cycle = setInterval(changeBG, 100);
        ind = true;
    } else {
        clearInterval(cycle);
        ind = false;
    }
};

а можно обойтись и без второй переменной
т.к. setInterval возвращает Id таймера, можно его и проверять и потом соотв. сбрасывать

var timer

item.onclick = function(){
    if (!timer) {
        timer = setInterval(changeBG, 100);
    } else {
        timer = clearInterval(timer);
    }
};