Напишу сам ответ. Все-таки для определенного круга задач лучше использовать с++. Работа с NDK далась оооочень непросто, особенно в тандеме с нетбинсом. Но в итоге время счета на эмуляторе не на много превышает время счета в обычном десктопном приложении.
