• базовый синтаксис, встроенные методы массивов, синтаксический сахар в виде классов, es6 +-
  
• как функционирует DOM,
  
• событийную модель,
  
• зачем нужно SPA
  
• базовое понимание REST архитектуры
  

Я бы конечно определился, что такое более глубокое понимание. Для себя я бы обозначил глубокое понимание, как умение решать "бизнес-задачи" на языке JavaScript, наиболее эффективным образом.

Глубокое понимание, уже перестает относиться только к JavaScript, а начинает очень тесно взаимодействовать с общими паттернами которые есть в программировании.

Знать и уметь применять паттерны проектирования:

- Singleton
- publish/subscribe
- factory
- proxy
- facade
- strategy

Понимать структуры данных и понимать для чего эти структуры предназначены, сложности алгорит:

- Список, связанный список
- Деревья, бинарные деревья
- Очередь/Стек
- Графы

Уметь писать в ООП парадигме и в функциональном стиле, просто чистый код:

- SOLID
- fp (pipe, compose, curry, functor, monads, etc)
- SOA, понимание Service-oriented architecture

Понимание работы компилятора и интерпретатора, MaxKorz хорошо уточнил.

можно написать patch над модулем.

Каждый модуль в момент require('some-module') попадает в require.cache и далее данный модуль можно пропатчить.
Например:

// first.js
const add = (a,b) => a +b;
module.exports.add = add

// patched.js
const MODULENAME = './first';
const moduleToPatch = require(MODULENAME); // здесь мы кешировали нужный нам модуль

require.cache[require.resolve(MODULETOPATCH)].exports.add = (a,b) => {
 console.log('PATCHED ! ! ! ! ')
 return a + b;
}

// second.js
require('./patched');
const { add } = require('./first');

console.log(add(10, 20)) 
// PATCHED ! ! ! !
// 30

Естественно первым нужно подключать модуль для патча, чтобы он сделал первый require у себя

перейти на visual Code ? :)