Basecamp не пользовался, но с ваших слов понял что вы хотите разделять задачи по категориям.
1) Есть проектная настройка "Категории задач", которая позволит вам разделять задачи по категориям в рамках проекта. В сайдбаре проекта у вас появятся категории по которым вы сможете быстро переходить в нужные вам списки задач.
2) Вы можете завести "Настраиваемое поле" типа список, сделать его для всех проектов и использовать его как кросспроектные категории. Потом заведите по кросспроектнуму запросу на каждый вариант значения поля - в таком случае каждый запрос будет списком задач.
(Для вариант с запросами советую бесплатный плагин
Extra Queries)