используем mysql с базой на zfs партишене. если downntime в демяток секунд не критичен, в подобных ситуациях быстрее и надежнее выполнять следующее:
1. остановить mysql
2. снять zfs снэпшот партишена с базой (атомарная операция, выполняется моментально)
3. старотовать mysql
восстановление такое же, вместо п.2 — rollback, также атомарная операция