eternalSt

Доброго времени суток!

Вот одно из решений этой проблемы

gulp.task('version', function(){
  return gulp.src(['src/**/*.html','src/**/*.php']) // Добавлен return
    .pipe(replace('{{version}}', Date.now() ))
    .pipe(gulp.dest('dist/'));
});

Теперь эта функция будет возвращать поток.

Я не хочу переписывать, то что уже сказано другими людьми и не раз. Поэтому дам ссылочки для изучения вопроса.

Офф дока с описанием механизма для gulp 3.9.1 для gulp 4 (Вообще желательно всю прочитать, а не только эту часть)
Скринкаст по Gulp 4 от Ильи Кантора