Когда включен режим фокусирования, то часы становятся серыми и в ночной теме их не видно. Чтобы не выключать фокусирование (режим «не беспокоить»), а часы отображались нормально, нужно зайти в Настройки → Строка меню и док → Фокусирование и выбрать чекбокс «Показывать в строке меню». Чтобы не занимало лишнего места, когда выключено, в селекте выберите «во время использования».