Egor

Причин может быть много, чтоб явно ее установить изучите статистику и логи на серверах. Первым делом посмотрите не уперлись ли вы в выделенную полосу канала:) Проанализируйте вывод запроса SHOW STATUS в MySQL, посмотрите на загрузку винтов.