Такой баг возникает при взаимодействии свойств position: fixed и z-index. Сам недавно столкнулся с подобным.
Проблему решило добавление следующего свойства
-webkit-transform: translateZ(0)

У вашем случае добавьте его к этим селекторам

.navbar-fixed-top, .navbar-fixed-bottom {
    -webkit-transform: translateZ(0);
}