Словарь в питоне - неупорядоченная структура данных. Он не помнит порядка. Поэтому чделать то что вам хочется с помощью стандартного словаря невозможно.
Но для этого в стандартной библиотеке предусмотрен специальный словарь
OrderedDict (в модуле collections)
Чтобы создать OrderedDict с элементами в определенном порядке, нужно передать список пар:
users = OrderedDict([
("girafenok", {"password": "2341", "upload_files": 0, "files_size": 0}),
("bastax", {"password": "qwerty123", "files": 2, "files_size": "45 B"}),
("kuku", {"password": "kuku1332", "files": 0, "files_size": "12 GB"}),
])