Нужно проверить что все компоненты на страницах сайта корректно кешируются, проверить страницы компонента каталог и другие страницы. Это можно посмотреть через отладку в верхнем меню на странице сайта.
Также можно потестировать производительность в панели производительности в админке (покажет какие страницы создают нагрузку).
К сожалению без кеширования никакая оптимизация не поможет решить проблему производительности и cpu. Система тянет много тяжелых запросов.
