Мы для себя выбрали salesforce.com.
У них есть мощное и хорошо документирование API, что позволяет её привязать к чему угодно.
Например, к 1С, а она понимает выгрузки из Интернет-банкингов.
Силами двух программистов (один PHP, другой 1C-ник) допиливаем напильником и готово.
Другие CRMки (например, которые это уже и так умеют делать) будет сильно дороже, чем плата за «напильник», или если кто-то уже нашел — подскажите в уточнении к этому ответу.