1. может выходить из строя трубочки системы охлаждения - лечится заменой их.
2. Если видеокарта дискретная то может выходить из строя она (либо просто сильно греться в связи с запуском в что грузит видео)
1. Посмотрите какие настройки делаете.
2. Можно переместить на время каталоги из $(HOME)/ начинающиеся с точки (скрытые) и посмотреть результат.
3. Посмотрите - не влияют ли те программы на отображение внешнего вида окна.
Нужно провода по - 1, 2, 3, 6. а по цвету смотрите с чего начинается. Лучше если знаете что на том конце стоит (свитч или патч-панель), если не знаете то только пробывать. Вероятнее всего надо по варианту Б.