Вот единственная из общедоступных наработок: pyshtrih. Сам использовал для автоматизации настройки и сбора статистики с 400+ касс. Правда пришлось некоторые вещи допиливать самостоятельно.
К слову, я разработчик кроссплатформенного кассового ПО и мы используем свою закрытую реализацию штриховского протокола. Лучшего решения, чем реализация своими силами, мы не нашли. К счастью протокол полностью открыт и хорошо документирован.
Содержимое resolv.conf на сервере со Squid'ом замените на:
domain agc.com
search agc.com
nameserver 10.1.1.3
Если же необходимо чтобы именно DNS запросы от клиентов уходили на ваш Bind, то придеться либо настраивать NAT, как вам порекомендовали на другом ресурсе, либо на сервере со Squid'ом запустить какой-либо вариант кеширующего DNS-сервера, например dnsmasq.