Шаблон taxonomy.php служат для показа конкретного term'а таксономии, а не всего архива.
Попробуйте сделать архив у типа записи за которой закреплена эта таксономия. в register_post_type укажите параметр has_archive. Затем создайте шаблон archive-{ваш has_archive}.php
P/S значение has_archive не может совпадать с названием таксономии, придумайте что-нибудь другое ; )