ДД!
Если я правильно понял, то бекапить нужно Физические хосты, то как вариант можно попробовать www.macrium.com/Business.aspx , по сути умеет все что описано, но я не совсем понял "Умеет создавать загрузочные флэшки" - перенос ОС на флеш накопитель? по сути тоже умеет.

Более распространенный, возможно, https://www.veritas.com/content/dam/Veritas/docs/d... , но описание по слабее =)

Но если бекапить виртуальные машины ESXi или Hyper-V то Veeam B&R

Есть идея переснять образ системы, на виртуальный диск формата .vmdk, То есть сперва создать такой диск, затем на него с помощью утилиты, к примеру: www.macrium.com/reflectfree.aspx (на мой взгляд очень удобная тем что тащит загрузочный сектор), далее на гипервизоре выдаете те же мощности, что и на физике и должно по сути взлететь.