Как вы решаете проблемы с генерацией проектов в Android Studio?

Спасибо за развернутый ответ.
Было немного неожиданно, что нужно игнорировать файлы проекта - видимо особенность Gradle - посмотрел примеры eclipse проектов на нем - проектные файлы как правило игнорируются, а при импорте проекта происходит генерация всех необходимых файлов.
Ребята, которые начинали проект, в течении полу года коммитили изменения в проектных файлах ...