Прямо передать право владения общей папкой другому пользователю невозможно. Но можно сделать вот что:
1. Будущий владелец этой папки переносит или копирует файлы из общей папки (папка А) на свой Яндекс Диск в любую другую папку (скажем, папка Б). Переименовать папку А недостаточно, так как связь с исходной общей папкой сохраняется после переименования и перемещения.
2. Далее он делает папку Б общей для тех пользователей, которым ещё нужен доступ к этим материалам.
3. Вы удаляете папку А со своего Диска. После этого все подключённые пользователи потеряют к ней доступ, а её копии на их Дисках будут удалены.
При удалении аккаунта все данные на нём (включая файлы на Яндекс Диске) стираются с серверов безвозвратно — восстановить файлы невозможно.