Tagit-new отдельно от главной ul (tag-it )?

Кстати да, вот ссылка на реп разработчика. https://github.com/aehlke/tag-it

Как решить проблему неверного подсчёта отступов в браузерах?

@SergeiMeketyuk в примере на jsfiddle тоже нет, а вот в хроме есть. Версия 32.0.1700.107

Как решить проблему неверного подсчёта отступов в браузерах?

@SergeiMeketyuk jsfiddle.net/6J4R4 это стили 2-х блоков, без верхнего - он можно сказать не влияет.
Подобный "баг", наблюдается только в Chrome.

Как скрыть тег?

Не знаю что у вас ещё есть в коде, но выводит без

http://jsfiddle.net/gpuAs/

Может, лучше вы свой кусок кода более полноценный скинете?

Как провести изменение checkbox и radio?

Имелось ввиду подобное, но данным способом, лично у меня не получилось сделать как на изображении.

Как провести изменение checkbox и radio?

@aen хотелось бы средствами css (если возможно), сделать подобный <input type='radio'> как на картинке выше.
Собственно, при выделении вокруг появляется бордер, а "кнопка" заменяется изображением в виде галочки в круге.