Freemind.
Очень удобен в использовании (особенно если пользоваться клавиатурой для создания веток, редактирования и прочего).
Работает быстро, несмотря на то, что написан на Java. Знакомый тоже пользуется Freemind, потому как удобно, и у него FreeBSD. Вообще кроссплатформенность тоже в плюс.
