Просто положите конфиг в папку /etc/openvpn и ограничьте для него права на запись. OpenVPN будет подниматься при загрузке системы и работе NetworkManager-a не помешает, как и NetworkManager не помешает работе OpenVPN.
PS
К стати в таком случае сертификаты можно будет запихнуть в конфиг клиента, что, на мой взгляд, удобно, так как заботится об одном файле, проще, чем о пяти.
