Денис Колмыков

1. Попробуйте сервер активации установить вручную:
slmgr -skms
2. Доступен ли на сервере KMS порт 1688?

Открываются ли ссылки: https://sccm-pr1.domain.local:443/SMS_MP/.SMS_AUT?... и https://sccm-pr1.domain.local:443/SMS_MP/.SMS_AUT?... ?
Утилитой trace32 (пакет System Center 2012 R2 Configuration Manager Toolkit) просмотрите логи в SMS_CCM\LOGS (если память не изменяет, то лог Mpcontrol.log)