У меня похожая проблема c XenServer 6.5 (все обновления проставлены до XS65ESP1041) но только с gcc, не могу его поставить, yum install --enablerepo=base gcc ругается на
--> Finished Dependency Resolution
glibc-2.5-123.i686 from base has depsolving problems
--> Missing Dependency: glibc-common = 2.5-123 is needed by package glibc-2.5-123.i686 (base)
Error: Missing Dependency: glibc-common = 2.5-123 is needed by package glibc-2.5-123.i686 (base)
Хотя все стоит на своем месте
yum list --enablerepo=base glibc-common
Loaded plugins: fastestmirror
Loading mirror speeds from cached hostfile
* base: mirror.yandex.ru
Excluding Packages from CentOS-5 - Base
Finished
Installed Packages
glibc-common.x86_64 2.5-123.el5_11.1 installed
Я поставил на другой комп XEN и вот что удалось выяснить, до установки обновления XS65E003 все ставиться прекрасно и gcc сам обновляет нужные ему зависимости (glibc-common), но что делать если обновления уже проставлены?