Собери простейший преобразователь напряжения, из 13 вольт в необходимые 5 или любое другое.
www.outme.ru/raschyot-preobrazovatelya-napryazheniya.html
Помех мало на не заведённой машине, когда работает генератор помех предостаточно.
Напрямую заряжать от автомобильной зарядки чревато либо возгоранием либо просто выходом из строя аккумулятора ардуины — необходим контроллер заряда, в телефонах они на плате телефона, а то что к нему приходит от зарядки не особо важно, например нокию можно заряжать напругой от 5 до 9 вольт, а некоторые и больше, всё остальное делает внутренний контроллер питания.
Хотите заряжать заряжайте — ваше право, но я сам видел как вспыхивали аккумуляторы подключенные напрямую к напряжению с высоким током.