Для критичных рабочих мест стоит иметь бекапы системного раздела образом, по состоянию когда "всё настроил хорошо и радуюсь", "+добавил кое что, и работает ок"
Иной раз настройки и конфиги сильно дороги - временем и нервами оплачено.
Чем делать - вариантов много. от Ghost и Acronis TI, до - Рекомендую -
Veeam Backup - на отдельный выделенный съемный диск -
оно само все сделает, даже на ходу, во время работы
(ну, если что-то ответственное делаете - с бекапом повременить, а то ресурсы...)
Вставили, подождали - вынули.
На этом диске у вас будет и полная копия раздела, и инкременты к нему, для отката в выбранные состояния из доступных копий...
Еще вариант, если у вас не одна машина - UrBackup (еще Bacula/BareOS для продвинутых =)
Все они тащат образы и бекапы на ходу (пока вы работаете, и расписание не запрещает) по сети к себе.