Дмитрий Волков

Всем спасибо)
Нашёл ответ сам, но хочу поделится с теми кто столкнется с чем-то таким же.
Просто напросто нужно было при каждом нажатии на ссылку, то есть на миниатюру изображения сделать повторную проверку элементов. Выглядит это так:

$links.click(function (event) {
        event.preventDefault();
        $div = $('.four__galeria').find( " > .portfolio" ).find(" > .active");
        divIndex = $(this).parent().index();
        targetImg = $(this).attr('href');
        replaceImg(targetImg);
        $lightbox.fadeIn();
    });

Понимаю что для кого-то это выглядело просто, но я писал же что еще в этом всем чайник.