Не очень понимаю, что Вы хотите получить в итоге.
Если Вы изменили исходную строку, то к ней нужно добавить обновленный перевод.
А чтобы не возникало проблем с непереведенными строками, на этапе разработки новой версии плагина или темы нужно формировать новый файл переводов, с учетом новых строк. Собственно, по такому принципу и выпускаются новые версии WordPress. Механизм можно посмотреть на примере какого-нить плагина из каталога, допустим,
Akismet. По ссылке или на скриншоте ниже можно увидеть, что есть две ветки переводов Development и Stable. В Development на данный момент ожидают перевода 8 новых строк.