Могу разве что сказать что-то платное. У хорошего разработчика JetBrains есть отличная система YouTrack. Появилась недавно. Можно скачать уже готовые сборки для запуска под разные системы (где захотите, там и поднимете). Денег стоит, но разработчик такой, что его продукты стоят тех денег. API есть, клиенты под iOS и Android тоже есть. Оповещения на почту и мессенджер видел лично. Про СМС не могу только ничего сказать. Дальше дело за вами.