Santos2004, обычно дев-версия работает с исходниками. но настроено может быть по-разному. Изучайте как настроена ваша сборка, или просто методом тыка удалите файлы, и посмотрите как будет работать.
1. Это же легко проверить. Добавьте объемный текстовый файл и сделайте пару коммитов с изменениями в одной строке. Каждый раз измеряйте объем папки с репозиторием (.git)
Были такие же симптомы, только более выраженные, так сказать, и на пару минут мог зависнуть диск Что происходит с жестким диском?
В тот раз у меня проблема решилась после замены блока питания на более мощный.
Кстати, тот диск до сих пор работает, хотя на первый взгляд казалось, что ему крышка.