Для object detection размечал с помощью labelImg, если не ошибаюсь. Простое и удобное приложение. Сохраняет адекватные аннотации в текстовый файл.

Для классификации писал простой скрипт на python, чтобы он мне штук 10 картинок в ряд показывал, а я в поле ввода писал 10 букв ассоциированных с классами. За вечер 10 тысяч так разметил.