linux raid (mdadm) использует начальную часть раздела под хранение метаданных данных массива. Поэтому файловая система непосредственно начинается немного позже. Обычно через 2048 секторов, можно посмотреть в mdadm -E /dev/том_массива, графа Data Offset.
Соответственно если вы больше не хотите использовать linux raid - то вам необходимо монтировать файловую систему со смещением (-o offset=...) либо передвинуть границу раздела в разметке диска (удалить раздел и создать такой же, но стартовый сектор указать на нужное число секторов позже).