Все продукты адобе "Запоминают" расположение окон. Думаю у тебя проблема в том, что ты с маком таскаешься с работы домой (к примеру) и моники внешние разные. Если на одном и том же месте сидишь и не отключаешь (вытыкаешь провод) второго моника - окна оставаться должны где ты их и оставил.
Еще вариант: расставил окна как тебе нужно и закрой приложение через файл->закрыть