идея такая:
1. зарегистрировать свою функцию в xslt, которая будет по узлу documentation возвращать содержимое
2. изменить XSLT стиль из пункта 3, чтобы он перед использованием прогонял узлы documentation через нашу функцию.
если бы xslt трансформация запускалась бы не ant, а, к примеру, php скриптом то такой трюк легко можно было бы сделать через registerPHPFunctions (
ru2.php.net/manual/en/xsltprocessor.registerphpfunctions.php )
может можно модифицировать схему на такую, что ant запускает просто php cli-скрипт, который и сделает трансформацию? тогда все решается через registerPHPFunctions