cvich

Вариант на Python:

import os

# path to main directory
path = '/your/path'

# table
files = {
    'file_1.txt': 'dir_1',
    'file_2.txt': 'dir_1/dir_2',
    'file_3.txt': 'dir_1/dir_2/dir_3'
    # others
}

# moving files
for file, directory in files.items():
    path_file = os.path.join(path, file)
    path_dir = os.path.join(path, directory)

    # checking for existence and creating directories if needed
    if not os.path.exists(path_dir):
        os.makedirs(path_dir)

    # checking for existence of the file in the target directory
    if os.path.exists(os.path.join(path_dir, file)):
        print(f"File {file} already exists in directory {directory}, skip.")
    else:
        os.rename(path_file, os.path.join(path_dir, file))
        print(f"The {file} file has been moved to a folder {directory}, success.")

# example moving:
#
# /your/path
# |-- /dir_1/file_1.txt
# |-- /dir_1/dir_2/file_2.txt
# |-- /dir_1/dir_2/dir_3/file_3.txt

1. Возьмет данные из таблицы files.
2. Переместит файлы (не существующие директории будут созданы, а уже существующие файлы не будет перезаписаны).

Файлы необходимо разместить по адресу из переменной path.

Такое можно сделать быстро с помощью экселя. Из таблицы формируете столбец, в котором будет сконкатенированы команды вида

rename прошлый\путь\к\файлу.txt новый\путь\к\файлу.txt

построчно для каждого файла. Копируете этот столбец, вставляете в текстовый .bat-файл и выполняете его.