Не знаю, будет ли работать на Linux, но на Windows все работает.
System.out.println((char) 27 + "[31mWarning! " + (char)27 + "[0m");
Если хочешь другой цвет, то измени "[31mWarning!". Например, на "[35mWarning!". Текст будет пурпурным.
30 - черный. 31 - красный. 32 - зеленый. 33 - желтый. 34 - синий. 35 - пурпурный. 36 - голубой. 37 - белый.
