Операция record-only merge является рекомендованным способом блокировать ревизию для merge. Для этого даже есть специальная опция: "--record-only"
Т.е. ветке нужно выполнить команду:
svn mege --record-only -c 100 "^/trunk"
См. раздел Blocking changes в главе Advanced Merging