Sergey

На примере фреймворка Yii
www.yiiframework.com/doc/guide/1.1/ru/database.mig...
www.yiiframework.com/doc-2.0/guide-db-migrations.html
www.youtube.com/watch?v=cugnRoZ1ick&feature=youtu.be

Миграции - это классы на PHP. Они размещаются в git.
Класс миграций содержит метод для апгрейда (наката) и даунгрейта (отката) изменений.

В базе данных есть таблица с списком установленных файлов миграций.
При установке или обновлении проекта, специальная команда выполняет анализ директории с файлами миграций (их может быть несколько), сверяет с таблицей.
Предлагает установить (накатить) те файлы миграций, которых нет в базе.

Можно попросить отменить (откатить) изменение или установить его ещё раз.

В миграции можно и структуру таблица поменять (миграция модели), и данные изменить (миграция данных).

У нас в скрипте установки (на тостере: Какой workflow front-end разработки у вас? ) делается бакап базы перед обновлением и после обновления. Есть ручной скрипт отката, чтобы базу восстанавить.
А в идеальном случае надо постараться так написать код, чтобы он мог без сбоев работать и с старой, и с новой моделью базы.

Итоговое решение

Устанавливаем php5-cli
apt-get install php5-cli

1.
Добавляем в cron задачу, которая будет выполнятся каждую минуту.
Набираем crontab -e и добавляем

*/1 * * * * /usr/bin/php -q /server/cron/cron.php > /dev/null 2>&1

сохраняемся (у меня SHIFT+Z 2раза)
> /dev/null - означает отправку результатов, которые выдаст скрипт, в никуда.
2>&1 - избавляет администратора сервера от писем, если скрипт закончит работу с ошибками

2.
для отправки на почту воспользуемся mutt (почтовый клиент)
apt-get install mutt

добавляем в cron задачу, которая будет выполнятся каждый час (в ноль минут), сохранит результат выполнения скрипта в файл и отправит его на почту с темой cron-result (в нашем случае в теле письма, но можно и приложением).
Набираем crontab -e и добавляем

0 */1 * * * /usr/bin/php -q /server/cron/cron.php > /server/cron/cron.txt && mutt my@email.com -s cron-result < /server/cron/cron.txt

сохраняемся (у меня SHIFT+Z 2раза)

Все готово.