Леонид

core.net не требует никакого web.config

проверте какой пул для этого сайта в настройке IIS
должен быть выставлен custom а не те что для стандартного .NET

а какая вам разница какой там процесс

по запросу срабатывает метод адресуемого контроллера и все

PHP фрйемворки тоже так работаю через echo ща никто данные не выводит

FTP вообще там ни при чем ему все равно

Обычно разница в том что на линухе имена файлов чуствительны к регистру

гугл вам тут не поможет