«Говорить что Java хороша, потому как работает на всех платформах это тоже самое что говорить что анальный секс хорош, потому что работает на всех полах.»
Посмотрите в сторону doxygen, там нет вики-форматирования и я не уверен что там есть кликабельное оглавление в pdf, но все остальное там точно присутствует.
