Довольный Айтишникъ

Вот тут описывается подобная ошибка и отмечено решение, посмотрите
https://stackoverflow.com/questions/47803081/certb...

Возможно причина в этом

Google Chrome is rolling out v63 that now forces all .dev domains to use HTTPS

https://laravel-news.com/chrome-63-now-forces-dev-...

Если не ошибаюсь то поддерживаются условия if else, что-то типа такого

<If "%{HTTPS} == 'on'">
  AuthName "Files are protected, enter your normal website email and password"
  AuthType Basic
  AuthUserFile /home/sites/mysite.co.uk/.htpasswd
  Require valid-user
</If>
<Else>
  RewriteEngine On
  RewriteRule ^(.*)$ https://%{HTTP_HOST}%{REQUEST_URI} [L,R=301]
</Else>

Никак, только в конфиге апача править, так как он ждет b.com и ничего кроме этого.

Судя по ошибке в логе

[Tue Nov 27 15:44:01.869614 2018] [core:alert] [pid 28242] [client 178.207.76.118:11369] /var/www/.htaccess: Either all Options must start with + or -, or no Option may.

строку Options -Indexes FollowSymLinks MultiViews надо изменить как то так Options -Indexes +FollowSymLinks +MultiViews апач хочет чтоб было явно указано + или -

А как вы собираетесь два веб сервера подружить на одном порту? Ведь они пытаются использовать 80 и 443 порты. Если вы в Nginx создадите сайт на нестандартном порту то оно должно заработать

Хозяин user, а из под какого пользователя запускается php-frm? Выставьте хозяином того же пользователя и пробуйте.

Да, это cpanel, если есть там параметр AutoSSL то отключите его.