Сергей

Вы также должны учесть, что информация на жестком хранится минимальными порциями, например по 16 кб или по 4кб (не помню точно).

Получается вы будете иметь значительных оверхед на жестком.

Для начала нужно определится, что за данные у вас там. И почему например вы юзаете InnoDB, а не MyISAM ? А попробуйте MariaDB, там есть другие движки из коробки, может что поможет.

Что касается 100Гб - а вы что хотите всю БД в памяти держать ? а зачем ? достаточно держать индексы + совет в лоб: перенести данные на SSD (это если у вас много случайных чтений по БД). На худой конец если вам нужен текстовый поиск, то возьмите Sphinx (его индексы занимают мало места).

У вас не BigData. Берите обычную БД и шардите данные на несколько таблиц (это максимум что вам нужно).