VDS администрируют абсолютно так же как и "железные" сервера.
понятие "локальное администрирование" для серверов вообще не очень уместно, тут все всегда удаленно.
Кроме консоли в которую можно попасть по ssh, хостеры часто предоставляют так называемые "административные панели" самые популярне это cpanel и plesk. они представляют из себя вебморды, в которых "одним кликом" можно настроить практически все базовые вещи на сервере.