От этого нельзя избавиться, потому что таблица assets используется для ACL - прав доступа к элементам (материалы, контакты и т.д). Туда же пишется информация сторонних компонентов, если они у себя используют ACL.

Отключить ACL в Joomla, к сожалению, невозможно.

Если найдете такой компонент материалов, который работает без ACL, то вероятнее всего, получите выигрыш в скорости и таблица расти не будет.

Вы это серьёзно? 3.3.1? Вы видимо не всё проверили. Начинайте отсюда и потихоньку идите к более свежим уязвимостям:
https://developer.joomla.org/security-centre.html?...

Нужно что-то вроде такого https://github.com/JBZoo/CrossCMS
Но я бы не стал пытаться, проще разрабатывать отдельно.