Прежде всего надо отметить, что время одиночек прошло. Программа мессенджер типа телеграм потребует участия множества специалистов. Это и программистов толпа, кто на серверной части, кто на клиентской, кто на хранении данных. Это и сисадмины. Прочие архитекторы и менеджеры.
Также требуется куча денег и согласие правительства, если для РФ делать будете.
Но в общем ответ такой.
Разберитесь что такое демон и сокеты. Научитесь запускать софт в фоне, который читает какой то порт и что то по этому поводу делает. После этого станет значительно понятнее вам, что должна делать серверная часть, а что клиентская. Хранение данных будет легче.
зы
как говорится бог в помощь, больше вам помочь абсолютно некому.