aspisklov

Решил проблему с помощью костыля.
В файле стандартного шаблона умного фильтра catalog.smart.filter/.default/template.php дописываем после 156 строки следующий код

<? //Сортировка по алфавиту
					foreach ($arItem["VALUES"] as $key => $sortkey) {
						$values[$key]  = $sortkey['VALUE'];
					}
					array_multisort($values, SORT_ASC, $arItem['VALUES']);
					unset($values);
					?>