У нас хранилки на чистой фре работают. 2x10Gbit сетевухи, multipath, тонкое провизионирование, VAAI, все дела. На дисках ZFS в разных позах (zmirror, raidz{2}). Луны создаём на zvol'ах, iSCSI target -- на базе ctld. Всё работает чотко.
Оказывается отслеживание удаленных или переименованных файлов по умолчанию отключено в bareos и чтобы включить эту опцию надо в секцию job файла bareos-dir.conf добавить параметр Accurate = yes. Тогда удаленные файлы не восстанавливаются при restore.
Я бы брал Xeon E5 у него только кеш меньше, по остальным параметрам он лучше. Ну и личное ИМХО я больше интелам симпатизирую, у меня с ними проблем меньше было.