Артур Смирнов

Valentina Studio - кроссплатформенная, на мой взгляд удобнее Navicat, поддерживает тунелирование как через ssh, так и по http.

Так если это сложно, может быть и не нужно их нормализовать? Часто наоборот делают денормализацию БД для повышения производительности приложения. А целостность данных гарантируется в моделях приложения.

Для выявления причины тормозов воспользуйтесь Slow Query Log (можно почитать тут). Когда найдете тормозящие запросы, попытайтесь их оптимизировать. Возможно имеет смысл кешировать результаты медленных запросов в памяти (memcache, redis, etc.).

И еще небольшой совет для повышения производительности работы с БД - перейдите с mysql (которая уже deprecated) на mysqli или PDO. На Mysqli перевести существующую систему не составит труда, она может работать в функциональном режиме и похожа синтаксически на mysql.