К сожалению битрикс не ориентирован на нормальную разработку в плане дев-сред и тд. В его случае алгоритм следующий:
1. Делаете отдельно фронтенд часть проекта (верстка и тд)
2. Билдите верстку в styles.css
3. Закидываете сбилженные стили в папку темы битрикса (local/templates/ваша_тема/)
4. Подключаете файл в шаблоне header.php в той же папке темы
5. Profit
Дальше закидываете просто новые сбилженные стили.
